新生兒頭頂頭發少與很多因素有關，多數為生理性因素，但也有可能是病理性因素所致，如先天性外胚層發育不全等，家長應該需要注意觀察和辨別，必要時帶新生兒就醫診治。
一、生理性因素：人體頭發的多少和質量受遺傳因素、營養因素及外界因素等多方面影響，新生兒處于一個生長發育的特殊時期，皮膚毛囊也處于發育狀態，部分毛囊發育尚不成熟可導致頭頂頭發少。新生兒的頭發有個體差異，出生時頭發的數量和顏色對以后頭發的特征沒有明顯影響。如果新生兒吃奶、大小便正常，且體重增長、精神反應等均正常，可以繼續觀察，科學喂養有助于毛發的發育。
二、病理性因素：1、先天性外胚層發育不全：由于外胚層先天性發育不良，導致皮膚及其附件發育異常，典型的無汗性外胚葉發育不良的表現為三聯征，包括少汗、少毛、牙缺陷，還可伴有頭發及體毛稀少、干燥、脫落，導致新生兒頭頂頭發少。治療上主要為對癥處理，避免環境溫度過高，長大后可戴假發、安裝假牙等；
2、其他：如患有Menkes氏綜合征，代謝異常導致頭發稀少、頭頂頭發少、短脆，若伴有發旋異常提示可能有腦發育異常，伴有頂枕部頭皮病變，如發紅、皮疹等，以及頭面部畸形是典型的13-三體綜合征的表現，提示有染色體病的可能，均可能導致新生兒頭頂頭發少，需要完善遺傳代謝檢查及基因檢查協助判定病情。