射干屬于清熱解毒類藥物，目前尚未發現射干與其他藥物以及食物一起使用而發生不良反應的現象，且中醫中關于藥材配伍禁忌的十八反以及十九畏中，也沒有關于射干和其他藥物發生反應的描述，但射干性寒，不建議和溫補類藥物以及溫性食物一起使用。
射干性寒、味苦，歸肺經，具有清熱解毒、消痰利咽的功效，臨床上用于熱毒侵犯上焦引起的一系列疾病，射干不建議和溫補類藥物一起使用，如金匱腎氣丸、右歸丸、參苓白術散等，雖不會發生不良反應，但一起使用會降低射干的療效。此外，射干也不建議與溫性食物一起使用，如羊肉、牛肉等，兩者一起使用也會降低射干的功效。射干可以配合瓜蔞、梔子、桑白皮等藥物，對由于邪熱壅肺導致肺氣不利、肺失宣降所引起的咳嗽、咳黃痰、氣喘等癥狀，有較好的化痰、清熱的功效。射干也可以搭配板藍根、蘆根、葛根、白茅根等藥物，對邪熱上攻咽喉所致的咽痛、咽干等癥狀，也有清熱利咽效果。