一般情況下，兒童肛門鎮定劑副作用是否大，需要根據藥物劑量來判斷，若劑量比較少，兒童肛門鎮定劑副作用不大，若劑量比較多，那么兒童肛門鎮定劑副作用大。
若使用的兒童肛門鎮定劑的劑量比較少，能夠起到一定的鎮靜作用，并不會在一定程度上刺激兒童，因此兒童肛門鎮定劑副作用不大，通常不需要過度擔心。若使用的兒童肛門鎮定劑的劑量比較多，再加上沒有嚴格遵循醫囑用藥，藥物會進一步刺激兒童，造成部分兒童出現巨幼紅細胞性貧血、走路不穩、呼吸異常等，嚴重情況下，可能會危及兒童的身心健康，因此兒童肛門鎮定劑副作用大。
一般在日常生活中，兒童需要注意臥床休息，通過改善睡眠環境、增加睡眠時間，進而保證兒童得到足夠的休息，避免兒童由于休息不足，造成兒童生長、發育受阻。
此外，若兒童使用肛門鎮定劑后出現不適感，需要及時到醫院接受進一步檢查，根據檢查結果進行針對性治療。