頭孢呋辛和頭孢呋辛酯的區別在于藥物成分不同、適應證不同、不良反應不同等方面，如因疾病需要使用上述藥物，建議患者前往醫院咨詢醫生后，在醫生指導下使用，切勿私自濫用。
1、藥物成分不同：頭孢呋辛酯是頭孢呋辛的酯化物，有效成分還是頭孢呋辛，頭孢呋辛酯更易在胃腸道中被吸收。
2、適應證不同：頭孢呋辛屬于二代頭孢類藥物，可以作用于細菌的細胞壁，導致細胞壁的破壞而殺滅細菌。通常用于敏感菌群的治療，臨床上多用于治療中耳炎、支氣管炎、肺炎、扁桃體炎等疾病。
頭孢呋辛酯適用于敏感細菌引起的感染，如上呼吸道感染，包括化膿性鏈球菌引起的咽炎、扁桃體炎，以及肺炎鏈球菌、嗜血流感桿菌、卡他莫拉菌或化膿性鏈球菌引起的急性細菌性中耳炎，以及肺炎鏈球菌或嗜血流感桿菌引起的急性細菌性上頜竇炎等。
3、不良反應不同：頭孢呋辛的不同反應包括胃腸道反應，可有惡心、嘔吐、腹瀉、食欲不振，假膜性結腸炎等。頭孢呋辛酯的不良反應包括消化系統反應，如腹痛、腹瀉、惡心、嘔吐、食欲減退、口腔潰瘍等，以及皮膚反應，如皮疹、紅斑、瘙癢等。
除此之外，兩者在副作用、禁忌證、注意事項等方面也有一定的區別，如果存在感染，建議及時前往醫院的普內科就診，完善血常規、細菌培養等檢查，以便明確病原體后在醫生指導下針對性用藥。