午睡起來后腦勺疼可能是睡眠姿勢不當導致局部長期受壓而引起，改變姿勢或進行頭部按摩后就會緩解。如果排除睡眠姿勢不當，應考慮與偏頭痛、高血壓、腦供血不足等疾病有關，需要積極治療原發疾病。
1、偏頭痛：是由于腦血管功能紊亂所引起的一種劇烈性頭痛，病程較久、反復、頑固，大部分患者有家族史，以反復發生的頭痛為特征，可伴有惡心、嘔吐，對光及聲音過敏等特點，可出現在睡醒后。患者應遵醫囑使用吲哚美辛片、布洛芬緩釋膠囊等藥物進行止痛治療，也可以配合按摩等物理治療；
2、高血壓：是指在靜息狀態下動脈收縮壓和(或)舒張壓增高，因血壓過高會影響腦部動脈血液循環，使血液循環流動速度加快，從而壓迫動脈血管壁和腦部神經導致，以晨起、睡醒后增劇為特征，白天或活動后漸漸減輕，疼痛性質、發作次數不一，多為頭部有沉重感，近似輕度頭痛或頭部緊縮感，表現為鈍痛。患者應平臥休息，并遵醫囑堅持服用硝苯地平緩釋片、阿替洛爾片、卡托普利片等降壓藥物，以免出現腦出血等嚴重并發癥；
3、腦供血不足：是指各種原因導致大腦出現廣泛的供血不足，由此引發腦部缺血、缺氧而出現不固定的疼痛、頭重、眩暈等一系列臨床表現，且癥狀可在睡醒后加重。此時可以服用阿司匹林腸溶片、血塞通膠囊、單硝酸異山梨酯片等藥物緩解不適，日常應注意休息，避免過度勞累。
除以上常見因素外，頸椎病等疾病也會導致該癥狀，建議患者及時就醫，避免癥狀持續加重而影響后續治療。