如果原發疾病控制良好，基底節區出血復發率一般不高，否則復發率可能比較高。
基底節是位于大腦半球基底部的一組體積頗大的灰質核團，基底節區出血是腦出血比較常見的類型，大部分都是高血壓控制不佳所致，如果病情控制良好，二次出血的概率比較低，所以復發率通常不算高。
但是部分患者的高血壓病情控制不佳，容易引起動脈粥樣硬化、小血管玻璃樣變，在血壓反復波動沖刷時，局部會形成微小動脈瘤，當血壓變化比較劇烈時，一般會破裂而導致出血。在這種情況下，基底節區出血的復發率通常是比較高的，建議積極遵醫囑治療，以免延誤病情，對身體造成嚴重的損害。