掏耳朵咳嗽可能是正常的生理性因素導致的，也可能是外傷、外耳道炎等病理性因素導致的，建議患者及時就醫診治，可以做電子耳鏡、喉鏡、痰培養等相關檢查，明確病因后采取針對性治療。
一、生理性因素
人體的耳道、咽喉部位都分布有部分迷走神經，在掏耳朵時可能會刺激到迷走神經，發生神經傳導，從而影響到咽喉部位，引發了咳嗽。也可能是因為在掏耳朵時帶動外耳道振動，從而影響到咽鼓管，因為咽喉部位與咽鼓管相連，也可能會引發咳嗽。這些都是正常的生理情況，一般不做特殊治療。
二、病理性因素
1、外傷：如果在掏耳朵時使用了較為堅硬的挖耳勺，過于用力，損傷耳道鼓膜，鼓膜損傷后可能會牽連到咽喉部位，引發咳嗽。建議患者使用較軟的挖耳勺，不要過于用力，避免損傷耳道；如果耳道已經受損，應立即停止掏耳朵。如果耳道出現出血的情況，可能是炎癥感染，可以遵醫囑使用左氧氟沙星膠囊、阿莫西林膠囊等抗生素治療，消炎殺菌。
2、外耳道炎：如果患者患有外耳道炎，耳道可能會出現出血、水腫的癥狀，導致耳朵敏感度較高，容易受到損傷。在掏耳朵時因為耳道過于敏感，可能會引發咳嗽。患者可以遵醫囑使用氧氟沙星滴耳液、氯霉素可的松滴耳液等藥物治療，起到消炎殺菌、止癢止痛的效果。
除此之外，咽喉炎、扁桃體炎等疾病也可能會導致患者在掏耳朵時咳嗽，建議及時就醫診治，采取相應治療。建議患者在日常生活中不要過于用力掏耳朵，如果有耳朵受損的情況，應盡量不要掏耳朵。也要注意保護耳朵，盡量不要讓耳道進水，避免出血感染。