糞腸球菌肺炎為腸球菌肺炎的一個類型，屬于細菌性肺炎，可以遵醫囑使用的藥物包括青霉素類藥物、頭孢菌素類藥物、四環素類抗生素、喹諾酮類抗生素等。
1.青霉素類藥物：該藥物是一種常見的抗生素，如注射用青霉素鈉、氨芐西林膠囊等，由于其中含有β-內酰胺，可抑制細菌的細胞壁合成達到抗菌效果。若是出現糞腸球菌肺炎，可遵醫囑使用該藥物。
2.頭孢菌素類藥物：該類藥物是以天然頭孢菌素C作為原料，經半合成改造其側鏈而得到的一類抗生素，如頭孢呋辛酯片、頭孢克洛顆粒等，通常可以用于治療糞腸球菌肺炎，抑制糞腸球菌生長。
3.四環素類抗生素：如鹽酸多西環素片、四環素片等，能對敏感細菌起到較好的抑制效果，臨床上對于糞腸球菌所引起的肺炎病癥，也有一定的療效。
4.喹諾酮類抗生素：該類藥物是人工合成的含4-喹諾酮基本結構的抗菌藥，具有較強抑菌消炎效果，如鹽酸左氧氟沙星膠囊、氧氟沙星葡萄糖注射液等。臨床上可以抑制糞腸球菌生長，幫助減輕患者的臨床癥狀。
由于該病本身較為少見，同時單純用藥大多效果不佳，患者通常需在醫生指導下聯合使用上述藥物，可較好地抑制細菌增殖，能夠幫助緩解臨床癥狀。
