若食管充血水腫情況較輕且病因明確，有自愈的可能，但若出現時間較早或病因復雜，自愈的可能性較低，也不建議盲目等待其自愈，以免加重原有病情。
如果食管充血水腫是由輕度的飲食刺激引起，比如短期內食用了過燙、辛辣、刺激性食物等，且癥狀較輕，沒有明顯不適，在調整飲食后，有可能自愈。例如，避免食用刺激性食物，選擇清淡、易消化的食物，注意飲食規律后，食管黏膜可能會逐漸修復，充血水腫的癥狀可以緩解，不需要采取特殊的治療方法，但仍需密切觀察身體狀況。
如果是由嚴重的胃酸反流、食管潰瘍、感染等因素引起的食管充血水腫，并不能通過自身免疫達到修復局部黏膜的功效，通常難以自愈，也不建議盲目等待其自愈，需要選擇合適的方法進行治療。
例如胃酸反流患者由于胃酸長期刺激食管黏膜，導致食管充血水腫，這種情況需要采取相應的治療措施，如遵醫囑使用奧美拉唑腸溶膠囊、蘭索拉唑腸溶片等抑酸藥物，促進食管蠕動的藥物，如多潘立酮片、莫沙必利片等，對于感染引起的食管充血水腫，需要配合醫生根據病原體進行抗感染治療。
如果充血水腫持續不緩解或伴有其他嚴重癥狀，如吞咽困難、胸痛、發熱等，應及時就醫，日常要注意飲食衛生和合理搭配，避免食用可能刺激食管的食物，養成良好的飲食習慣，以降低食管充血水腫的發生風險。