核酸檢測取樣一般不痛苦，核酸檢測取樣的方式比較多，包括咽拭子取樣、鼻拭子取樣，以及肛拭子取樣等，較為常用的核酸檢測方式是咽拭子取樣。核酸檢測主要用來檢查是否被新型冠狀病毒感染。
核酸檢測屬于無創傷的一種操作，也是較為常用的一種操作。人們在檢查過程中需要配合專業人員，如張大嘴巴發出啊的聲音，將咽喉黏膜充分暴露，專業人員會使用一根較長的無菌棉簽，在短時間之內刮拭咽喉部位、咽喉壁、咽腭弓兩側的黏膜組織，由于無菌棉簽質地柔軟，所以通常不會產生明顯的疼痛感，大部分人群都可以接受。但是在取樣過程中，部分人群可能較為敏感，會導致咽喉黏膜受到刺激，可能會產生輕微干嘔的癥狀，經過休息之后，會逐漸得到緩解，所以核酸檢測一般不痛苦。