流感疫苗通常指的是流行性感冒病毒滅活疫苗。打完流行性感冒病毒滅活疫苗咳嗽了可能是疫苗不良反應、上呼吸道感染、支氣管炎、咳嗽變異性哮喘、肺炎等因素引起的，患者需要及時到醫院就診，并且配合醫生對癥治療。
1、疫苗不良反應：部分人接種疫苗后可能出現咳嗽等不良反應，一般癥狀較輕，可自行緩解。若咳嗽較嚴重，可在醫生指導下使用復方甘草片、氫溴酸右美沙芬片等藥物進行治療。
2、上呼吸道感染：接種疫苗后身體免疫力可能暫時下降，容易患上呼吸道感染，出現咳嗽等癥狀。患者可以按照醫囑使用復方氨酚烷胺片、氨咖黃敏膠囊等藥物進行治療。
3、支氣管炎：病毒或細菌感染可引發支氣管炎，導致咳嗽。患者可以按照醫囑使用復方甘草合劑、鹽酸氨溴索片等藥物進行治療。
4、咳嗽變異性哮喘：有哮喘基礎或易過敏體質的患者，接種疫苗后可能誘發咳嗽變異性哮喘。患者可以按照醫囑使用沙丁胺醇氣霧劑、布地奈德福莫特羅粉吸入劑等藥物進行治療。
5、肺炎：嚴重的情況下，可能發展為肺炎，引起咳嗽、發熱等癥狀。患者可以按照醫囑使用阿莫西林克拉維酸鉀片、左氧氟沙星片等藥物進行治療。
建議患者注意休息，多喝水，避免勞累和受涼。