靶器官損害指疾病針對的器官，也就是目標器官出現了損害。比如患有高血壓時，可最終累及心臟、腎臟、大腦。如果患者在血壓升高的同時，出現心臟增大、腎功能減退、間歇性跛行等情況，考慮是出現了靶器官損害。
1、心臟：作為靶器官之一，與高血壓關系密切，隨著血壓長期升高，可造成血管內皮損傷，從而造成冠狀動脈粥樣病變。同時高血壓具有的胰島素拮抗作用，可使動脈壁膽固醇沉積，影響管壁的脂代謝，也可造成動脈粥樣硬化；
2、大腦：高血壓對腦的損害，主要是通過對腦血管的損害及壓力本身兩方面所引起的，在正常情況下，大腦通過腦血管自身調節機制，維持腦血流量相對恒定。當血壓持續升高時，腦血管自身調節功能出現障礙，從而導致一種可逆性腦血管綜合征，主要表現為劇烈頭痛、嘔吐、意識模糊等。在高血壓機械性沖擊作用下的腦微動脈可能會發生纖維性壞死、管腔阻塞，從而使腦組織因血液供應被阻斷而發生梗死；
3、腎臟：高血壓持續較長時間，而又缺乏有效的降壓治療，會導致全身小動脈硬化和退行性變。高血壓對腎臟損害的基本病變為腎臟細動脈硬化、玻璃樣透明變性，使腎小球、腎小管缺血。早期這種變化程度較輕，臨床可能沒有癥狀，隨著病變加劇，腎小管的重吸收和腎小球濾過率下降，患者可有夜尿增多的表現，此時腎功能有輕度損害。晚期腎功能嚴重受損，尿素氮、肌酐明顯升高，由氮質血癥最終發展為尿毒癥。
高血壓的治療目的不僅是控制血壓，也要減少血壓升高所帶來的靶器官損害，如避免出現心臟肥厚、心功能衰竭、腦動脈瘤、腦血栓形成，甚至腦出血以及外周動脈疾病等。因此對于高血壓病人的治療，需要進行臨床評估，包括血壓水平，了解是否存在心血管的危險因素、是不是存在靶器官損害等，確定血壓的目標值以及確定血壓伴隨的其他代謝異常，有助于確定治療方案。