檸檬茶作為生活中較為常見的飲品，一般沒有副作用。檸檬茶內含有較多的水分、膳食纖維、維生素等營養物質，正常人適量飲用具有生津止渴、促進消化、補充營養等好處。但若飲用不當，或部分特殊人群飲用后，可能會出現胃部不適、損害牙齒、過敏等危害。
1、胃部不適：檸檬茶主要由檸檬制作而成，檸檬里面含有較多的酸性物質。若一次性飲用過多檸檬茶，就可能會對胃黏膜產生不良的刺激，從而引發惡心、反酸、腹痛等胃部不適癥狀，特別對于胃病患者而言，飲用檸檬茶可能會加重癥狀；
2、損害牙齒：如果過多飲用檸檬茶，里面含有的一些酸性物質附著在牙齒表面，可能會損傷牙釉質，尤其對于牙齒本身較為敏感的人群，更容易誘發齲齒等牙齒相關疾病；
3、過敏：本身對檸檬茶過敏的特殊人群，飲用檸檬茶后就可能會引起機體出現顏面部水腫、喉部不適、氣促、全身瘙癢等過敏反應，此類人群應避免飲用檸檬茶。
因此，日常可適量飲用檸檬茶，但不可將檸檬茶作為補充水分的主要來源。如有口渴、口干等情況，還是建議飲用溫開水。