基因檢測是陰性是否能用靶向藥，需要具體情況具體分析。如果為假陰性的情況，可以用靶向藥。如果多方面檢測確定陰性的情況，則不能用靶向藥。
1、能用：臨床發現部分病人有某種基因檢測的方法結果陰性，但是到另外一家醫院用另外的組織送檢，提示基因檢測陽性，說明第一家醫院做出的結果可能是假陰性，此時可以按照基因檢測陽性的靶點，給予對應的靶向藥治療；
2、不能用：如果進行基因檢測的多種方法結果都是陰性，或者取病人的腫瘤組織標本、漿膜腔積液、血液多項組織檢測，基因檢測均為陰性，一般不能用靶向藥。
另外，之所以基因檢測陰性結果的病人不用靶向藥，主要原因在于此類患者服用靶向藥后有效率低于10%。由于對靶向藥并不敏感，因此，不會將靶向藥作為首選方案。