一般來說，沒有“厭氧菌口臭吃什么藥效果最好”的說法，通常厭氧菌導致口臭吃甲硝唑片、替硝唑片等藥物效果比較好。具體分析如下：
厭氧菌是一類在無氧條件下比在有氧環境中生長好的細菌，如果患者不注意口腔衛生，導致其感染，可能會產生揮發性硫化物，進而引起口臭。通常患者按醫囑服用甲硝唑片、替硝唑片等藥物治療效果比較好，可以有效殺滅局部的厭氧菌。同時患者還應該保持良好的衛生習慣，做到飯后漱口、早晚刷牙。
此外，患者還應該定期前往正規醫院進行口腔檢查，如果出現異常情況，及時治療。