人流后二次清宮的危害通常比較大，可能會誘發子宮內膜變薄，影響正常的月經以及再次懷孕。但在人流之后，如果子宮當中有殘留，也會危害身體健康。
人流后二次清宮手術過程當中，通常會對子宮內膜造成一定損傷，使子宮內膜變得比較薄，日后可能還會出現月經量減少，以及月經周期變長的癥狀。如果頻繁做清宮手術，會使子宮內膜嚴重偏薄，之后不利于受精卵著床，影響再次受孕，即使在受精卵著床之后，也容易出現流產的情況。但在發現子宮里面有妊娠組織物殘留后，如果沒有及時做清宮手術，也會對身體造成嚴重的傷害，會出現大出血、腹部疼痛、休克等不良癥狀。因此在人流之后，如果發現子宮當中有妊娠組織物殘留，也需要做清宮手術，但在做手術的時候，需要選擇正規的醫療機構，以降低手術當中的危害。
在做完人流之后，需要做好個人的衛生護理工作，保持會陰部位的清潔，選擇穿寬松、透氣性好的棉質內褲，在短時間內不要有性生活，否則可能會誘發宮腔感染，甚至是再次懷孕的情況。