滴色甘酸鈉滴眼液眼睛疼可能是藥物成分刺激、藥物過敏等原因導致的，需要采取藥物治療、一般治療等方式來改善。
1、藥物成分刺激：色甘酸鈉滴眼液為西藥名，屬于抗過敏藥，主要用于預防春季過敏性結膜炎，其作用機制是穩定肥大細胞膜，抑制致敏介質，從而預防過敏反應的發生，本品主要成分為色甘酸鈉，可能會刺激眼部，導致眼睛疼。如果癥狀較輕，屬于正常情況，一般可以自行緩解；如果癥狀較重，患者需要及時停藥，或者更換藥物。
2、藥物過敏：患者滴色甘酸鈉滴眼液后，可能導致眼部發生過度免疫反應，能引起過敏反應的物質稱為變應原，可表現為眼紅、疼痛、腫脹等癥狀。患者可以在醫生的指導下使用氯雷他定片、鹽酸西替利嗪片、鹽酸苯海拉明片等藥物來治療。患者要避免再次接觸和使用該藥物，并且應清淡飲食，避免加重病情。
該藥物與其他藥物同時使用可能會發生藥物相互作用，詳情請咨詢醫師或藥師，使用后應將藥瓶蓋擰緊，以免瓶口污染，并且用前應洗凈雙手。