免疫熒光技術的基本原理主要是抗原抗體反應。
由于抗原抗體反應具有高度的特異性，當抗原抗體發生反應時，只要知道其中的一個因素，通常就可以查出另一個因素。免疫熒光技術是將不影響抗原抗體活性的熒光色素標記在抗體或抗原上，與其相應的抗原或抗體結合后，在熒光顯微鏡下呈現一種特異性熒光反應，通常具有敏感性強、特異性高、速度快的特點，是目前比較常用的組織學技術，也是比較精確的。
免疫熒光技術的要求很高，檢查時載玻片及蓋玻片要求干凈、無雜質。進行熒光染色時，需注意染液的pH值、濃度和染色溫度，還需要避免雜質的污染。