甲狀腺手術一般是采用全身麻醉，這種手術方法可以減少患者的痛苦，避免患者由于手術過程中處于清醒狀態而出現心理障礙，還可以增加手術的安全性，因此甲狀腺手術一般是全麻手術。
甲狀腺手術采取全身麻醉，不僅可以減輕患者疼痛，也可以減少術后并發癥。全身麻醉后，患者會處于意識消失狀態，此時呼吸中樞也會受到抑制，可從口腔中插入氣管導管，由呼吸機控制患者術中的呼吸，可以減少患者出現呼吸衰竭的概率，而且甲狀腺附近有豐富的血管、喉返神經等神經組織，還有甲狀旁腺等器官，因此手術需要特別小心，以免對這些正常組織造成損傷，而全麻狀態下病人的狀態更容易控制，因此可以降低損傷正常組織的概率，減少術后并發癥的發生。如果患者沒有呼吸困難，生命體征比較平穩，即可安全送回病房，一般沒有麻醉并發癥。
部分病人患有某些疾病，特別是高齡老人不能耐受全身麻醉的情況下，也可以選擇局麻，比如神經阻滯麻醉。神經阻滯麻醉就是阻滯兩側頸叢神經，包括淺叢或者深叢，阻滯以后再輔助強力的鎮靜藥，病人可以處于較淺的睡眠狀態，手術過程中通常也不會感到疼痛。
甲狀腺手術全身麻醉后，回到病房中應采取平臥位，保持呼吸道通暢，頭偏向一側，防止病人誤吸，嚴密監測心肺功能，大多數病人在術后1-2小時就可清醒。