肉豆蔻酸異丙酯主要應用于潤膚劑、護膚品、化妝品等。如果長時間使用含有肉豆蔻酸異丙酯的化妝產品，同時沒有及時做好皮膚的清潔和護理，容易引起毛孔堵塞，出現長痘的情況。對肉豆蔻酸異丙酯過敏的人群，使用后也會產生一系列過敏反應。
1、毛孔堵塞：肉豆蔻酸異丙酯是一種無色、無味的制劑，呈現出透明狀態，且不容易被水分解，大多數會存在化妝品當中，在化妝品里面起到的粘合作用，雖然對于皮膚能起到一定滋養作用，但如果過量使用后，容易沾浮空氣當中的灰塵，如果不注重皮膚的清潔衛生，可能會加重皮膚負擔，刺激皮脂腺分泌過量的油脂，分泌的油脂堵塞在毛孔中，很容易引起毛孔堵塞，長此以往會出現長痘的情況；
2、過敏反應：肉豆蔻酸異丙酯是較常用的酯類促滲劑，能進入角質層，促進藥物在基質和皮膚間的分配。如果對肉豆蔻酸異丙酯出現過敏，使用后可能會導致機體出現異常的免疫反應，造成一系列的過敏反應，如皮膚瘙癢、丘疹、紅斑、腫脹等情況，特別是對于敏感體質的人群，很可能會導致接觸性皮炎，不利于身體健康。
如果對肉豆蔻酸異丙酯不過敏，在適量使用含有肉豆蔻酸異丙酯的物品后，不會引起明顯的不良情況，同時能很好地滲透到皮膚當中，改善皮膚粗糙的問題。