根管治療沒有根充到應有的長度，即根部，久而久之可引起根尖周炎而出現咬合痛。因為根管治療未根充到相應的部位，在根尖部位可殘存細菌，久而久之可在身體免疫力下降時，發生急性感染。且細菌可通過根尖孔達到根尖周圍組織，造成急性或慢性根尖周炎。慢性根尖周炎患者在身體抵抗力下降時，亦可出現急性發作。臨床主要表現為患牙根管治療后疼痛持續存在或根尖周疾病的病損經久不愈。
根管治療是治療牙髓炎、根尖炎的有效的治療手段，通過拔除牙髓腔內的牙髓或已壞死的牙髓，然后進行根管換藥、根管預備、根冠沖洗、根管消毒和根管充填，即可達到充填物與根管壁緊密貼合，嚴密縫合整個根管系統的目的。若達到充填物內沒有空隙，即可保持根管內無細菌存在。正常情況下，若進行根管治療后，通過X線片可顯示根充物已到達距離根尖0.5-2mm的恰當長度。若長度不足則稱為欠填，根尖部可殘留革蘭氏陽性非厭氧菌或者兼性厭氧菌，不但可以造成周圍的細菌感染，亦可造成根尖周圍的感染。
因此在進行根管治療時，應徹底進行預備，達到應有的長度再進行根充，避免出現欠填，才能達到根管治療的目的。