一般情況下，肚臍眼右上方3-5厘米疼痛可能是消化不良的非病理性因素引起的，也可能是闌尾炎、腸胃炎、輸尿管結石等病理性因素引起的，需要根據實際情況進行相應處理。
一、非病理性因素
消化不良會導致肚臍眼右上方疼痛，同時伴隨脹氣、惡心、嘔吐等癥狀，日常生活中需要適當減緩進食的速度，不能暴飲暴食，對食物進行充分咀嚼后再吞咽，有利于保護胃腸道健康。
二、病理性因素
1、闌尾炎：該疾病的后期表現為右下腹疼痛，一般可以前往醫院進行腹腔鏡闌尾切除術或開腹闌尾切除術切除闌尾治愈。
2、腸胃炎：腸胃受病菌影響產生炎癥，會使患者臍周產生疼痛感，同時伴有惡心、嘔吐等癥狀，可以在醫生指導下服用奧美拉唑腸溶片、埃索美拉唑鎂腸溶片、匹維溴銨片等藥物改善胃腸道健康。
3、輸尿管結石：結石在移動過程中會出現右下腹絞痛，一般可以進行手術將結石擊碎取出。
如果患者出現肚臍眼右上方疼痛，需要及時前往醫院就診，通過腹部立位平片、胃鏡、泌尿系統超聲等檢查明確病因后，在醫生的指導下進行針對性治療。