通常情況下，沒有復合乳酸菌腸溶膠囊和雙歧桿菌哪個好的說法，通常都是比較好的。具體情況分析如下：
復合乳酸菌腸溶膠囊含有乳酸桿菌、嗜酸桿菌、乳酸鏈球菌等活乳菌素，在醫生的指導下服用藥物之后能夠起到一定的抑制腸道里面腐敗細菌繁殖以及調整腸道菌群的效果，還能減少脹氣，同時也可以促進食物消化、吸收，可以治療腸功能紊亂的癥狀；雙歧桿菌的常用劑型為散劑、膠囊劑等，為消化類藥，可以直接補充人體正常的生理菌群，調整腸道菌群平衡，抑制和清除腸道當中一些有危害的細菌，復合乳酸菌腸溶膠囊和雙歧桿菌通常都是比較好的。
建議患者在用藥的時候根據自身的體質，然后在醫生的指導下選擇合適的藥物。