手足口病疫苗主要針對的是腸道病毒EV71型引起的手足口病，對于由EV71病毒感染引起的手足口病，保護效率可以高達90%以上。
手足口病的病原體并非僅有EV71一種，還可能由其他病毒如柯薩奇病毒等引起。因此，即使接種了疫苗，也不能完全保證不會得手足口病，但可以顯著降低由EV71病毒引起的重癥手足口病和死亡病例的發生率。
手足口病疫苗一般在兒童6個月大時開始接種，因為在這個年齡階段，兒童感染手足口病的概率相對較高。疫苗的效果一般可以持續2到3年。至于為什么三歲后通常不再接種手足口病疫苗，這主要是因為三歲后兒童的免疫系統逐漸完善，身體抵抗力增強，手足口病的發病率和重癥率也相對較低。此外，疫苗的保護效果在接種后的幾年內仍然存在，因此沒有必要再次接種。
但是，這并不意味著三歲后的兒童完全不會感染手足口病。在日常生活中，仍需要養成良好的衛生習慣，保持飲食均衡和適當鍛煉，以增強身體抵抗力。同時，家長和監護人也需要密切關注兒童的健康狀況，一旦發現疑似手足口病的癥狀，應及時就醫治療。