透膿散和托里消毒散的區別通常是成分不同、功效不同、適用病癥不同、作用階段不同、用藥目的不同等，患者應在中醫醫師的指導下用藥。
1、成分不同：透膿散主要成分是生黃芪、當歸、皂角刺等；托里消毒散主要成分是人參、黃芪（鹽水拌炒）、當歸、川芎等。
2、功效不同：透膿散具有托毒潰膿的功效；托里消毒散具有扶正托毒，消腫潰堅的功效。
3、適用病癥不同：透膿散用于癰疽諸毒、內已成膿、不潰不破者。托里消毒散用于癰疽已成，或潰后膿水清稀、堅腫不消、瘡口不合等。
4、作用階段不同：透膿散主要用于癰疽成膿期，促使膿液排出。托里消毒散在癰疽初期可扶正祛邪，防止病情發展；在成膿期有助于膿液排出。
5、用藥目的不同：透膿散重點在于透膿外出，使膿液破潰排出，防止毒邪內陷。托里消毒散更注重整體調理，通過扶正與祛邪相結合，增強機體抵抗力，促進瘡瘍的愈合，防止病情反復。
在治療期間，患者要注意保持瘡口清潔，避免感染加重。