重新進行根管治療時，要想將填充物完全、徹底取出，通常比較困難。因為臨床上采用的大部分都是現代根管治療方法，通常是采用熱牙膠垂直加壓充填的辦法，使根管腔內部不留任何縫隙，全部由熱牙膠充填。但熱牙膠冷卻之后會變硬、變堅固。因此，如果想取出根管內的熱牙膠非常困難，尤其是對于細根管、彎曲根管或者是磨牙的多根牙根管而言，將填充物全部取出比較困難。
重做根管治療常見于根管欠填、根管超充或者有根管遺漏的情況。針對于堅硬的熱牙膠，臨床通常需要使用溶解牙膠的有機溶劑，也就是將有機溶劑導入根管內，將熱牙膠溶解一部分之后，再采用根管銼、擴大針等器械，將根管內的填充物逐漸取出，必要時可以通過根管顯微鏡直視下取出根管內填充物。